Минфин в письмах от 23.07.2012 № 03-07-08/211; от 05.12.2011 № 03-07-11/335; от 09.10.2006 № 03-04-08/209 вроде бы не против принять НДС к вычету после оприходования оборудования на сч. 07.
А вот с налоговиками проблемы могут быть, они часто настаивают на учете на сч. 01 оборудования для принятия НДС к вычету. Время от времени, даже суды на их стороне, например Постановление ФАС Западно-Сибирского округа от 15.07.2013 по делу №А67-2460/2012.Такая позиция была изложен и в Методических рекомендациях по применению главы 21 "Налог на добавленную стоимость" НК РФ, утвержденных Приказом МНС России от 20.12.2000 N БГ-3-03/447.
Однако Президиум ВАС РФ в Постановлении от 24.02.2004 № 10865/03 признал неправомерной позицию налоговых органов о том, что в соответствии с п.5 ст.172 и п.6 ст.171 НК РФ вычеты сумм НДС, уплаченных при приобретении внеоборотных активов, производятся по мере постановки их на учет в качестве основных средств. Но опять же это решение по конкретному спору.
Хотя многие эксперты ссылаются на мнения Минфина, ИФНС не всегда согласны с этой точкой зрения и требуют дожидаться постановки на сч. 01. Для возмещения НДС.
Думаю, никто на форуме не решиться Вам однозначно сказать: а принимайте к возмещению! а потом, если будут проблемы вы сможете с чистой совестью обвинить его в некомпетентности.
Хотя нужно сказать, что положительная судебная практика по этому вопросу все же имеется и шанс на положительный исход при принятии к возмещению достаточно велик.